Program Ekopesantren yang digagas oleh Pusat Pengajian Islam Universitas Nasional (PPI Unas) sebenarnya telah dilakuan oleh beberapa pondok pesantren atau lembaga yang mempunyai program pelestarian alam dan lingkungan. Malah beberapa lembaga telah memiliki pondok pesantren dampingan untuk melakukan kegiatan tersebut. Namun kegiatan itu masih dilakukan secara terpisah dan belum menjadi sebuah gerakan secara nasional atau bahkan secara internasional. Pondok pesantren memiliki potensi yang sangat besar untuk mengarah ke sana.